Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8005F6YKY3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8005F6YKY3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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