Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ryr1E9PZQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ryr1E9PZQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms