Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Prrt2E9PUL5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prrt2E9PUL5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.5 ms