Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam71aB7XG49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71aB7XG49 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71aB7XG49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms