Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt1A2BED8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms