Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms