Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms