Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL25A1Q9BXS0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL25A1Q9BXS0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms