Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUSC1Q9BVN2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms