Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna11Q61716 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms