Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXE3Q13461 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FOXE3Q13461 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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