Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RXRBP28702 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RXRBP28702 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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