Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM21P19474 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms