Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms