Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms