Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RCE1Q9Y256 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RCE1Q9Y256 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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