Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms