Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms