Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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