Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms