Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms