Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGNL1Q0VF96 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms