Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP1-1Q07627 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms