Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms