Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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