Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms