Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BORCS6Q96GS4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms