Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms