Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms