Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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