Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CD164Q04900 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms