Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSR4P51571 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSR4P51571 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms