Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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