Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD1BQ9UPS6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms