Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP74Q9C0B2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP74Q9C0B2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms