Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms