Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
D130052B06RikQ3UW13 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms