Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms