Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD8BP10966 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD8BP10966 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms