Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms