Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms