Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms