Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cabp1Q9JLK7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cabp1Q9JLK7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms