Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV5

FSD1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD1Q9BTV5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSD1Q9BTV5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms