Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul7Q8VE73 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul7Q8VE73 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms