Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSMPQ1L6U9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms