Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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