Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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