Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cntn3Q07409 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cntn3Q07409 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cntn3Q07409 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cntn3Q07409 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cntn3Q07409 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms