Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms